Hovedstyret behandler saker som kommer opp mellom Årsmøtene og har overordnet ansvar for all aktivitet i BUL Tromsø. Etter valg på Årsmøtet 2025 har hovedstyret følgende sammensetting:
Leder: Kari Lofthus
Medlemmer: Håvard Bernhardsen, Thomas Bøhn, Tor Schive og Brita Nilsen
Varamedlemmer: Randi Elisabeth Olsen.